의료데이터 분석가 성장기

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# 의료데이터 분석가 성장기
## 동국대학교 의생명공학과
### 김진섭; <a href="https://github.com/jinseob2kim"><span><i class="fab  fa-github faa-float animated "></i>jinseob2kim</span></a>
### 차라투(주)
### 2019-11-07

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<div class="my-footer"><span><a href="https://www.zarathu.com">Zarathu Co.,Ltd</a>   
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<a href="https://github.com/jinseob2kim">김진섭</a></span></div>

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# 소개

- 의과대학, 유전체연구 박사과정, 삼성전자 무선사업부를 거치며 임상, 유전체, 모바일헬스 등 다양한 데이터를 다루었습니다.

- 현재 연구지원법인 [차라투](https://www.zarathu.com) 를 운영 중입니다.

- [Shiny 밋업](https://github.com/shinykorea/Meetup) 의 진행과 후원을 맡아, 의료/축산/게임/반도체/신용평가/IPTV 등 다양한 분야의 사람들과 함께 Shiny 를 알아가는 중입니다.
]

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# Executive Summary

* 수학만 하다가 얼떨결에 의대 진학.

* 예방의학 전공하며 통계, 프로그래밍 공부.

* 삼성전자 근무하며 디지털헬스와 창업을 알게 됨.

* 통계 이론으로 박사논문 쓰려다 실패, 창업지원사업 선정.

* 통계지원 법인 설립.

- [R](https://www.r-project.org/) 과 [shiny](https://shiny.rstudio.com/) 이용, [**맞춤형** 분석웹](https://www.zarathu.com/) 제공
  
  - 범용 통계분석 웹: http://app.zarathu.com/
  
  - [R 패키지 개발](https://github.com/jinseob2kim/jsmodule)
]

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# 맞춤형 의학통계 지원

.large[
* 통계 분석
    + 일반 데이터: Table 1, 회귀분석, 생존분석
    
    + 반복측정: GEE(Generalized Estimating Equation)
    
    + 표본조사: [국민건강영양조사](https://knhanes.cdc.go.kr/knhanes/main.do)
    
    + Propensity score 분석: Matching, IPTW

* [공통데이터모델(Common Data Model, CDM)](http://www.feedernet.org/html/) 결과 확인.

* 심혈관 생리학 지표 계산: .yellow[드래그]

* 정신질환 .yellow[네트워크 분석]
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# 예: 시야 데이터 분석

기술통계, 회귀/생존분석, 간단한 그림

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# 예: 신장이식 환자 분석

기술통계, 회귀/생존분석, 맞춤형 그림

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# 예: Zip 압축파일 열기.

[zip](https://cran.r-project.org/package=zip) 패키지 이용, 결과 들어있는 .yellow[zip] 업로드하여 확인.

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# [통계분석 웹](http://app.zarathu.com/)

![](https://blog.zarathu.com/posts/2018-11-24-basic-biostatistics/app.gif)

- 무료

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# 프로그램 개발, 블로그 운영

- [jstable](https://github.com/jinseob2kim/jstable): 논문용 테이블 만들기

- [jskm](https://github.com/jinseob2kim/jskm): 생존분석 그림 만들기

- [jsmodule](https://github.com/jinseob2kim/jsmodule): 웹에서 하는 통계분석
]

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.large[
데이터 분석용 가상머신([docker](https://www.docker.com/) image)

- [rshiny](https://github.com/jinseob2kim/docker-rshiny): [Rstudio](https://www.rstudio.com/)와 [shiny server](https://www.rstudio.com/products/shiny/shiny-server/) 가 설치된 이미지.
]
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.large[
[블로그](https://blog.zarathu.com/), DC 프로그래밍 갤러리 고정닉
]

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# 공부모임: Shiny 밋업

- 월 1회 공부내용 공유.

- 의료/유전학/축산/반도체/게임/IPTV/회계 등 다양한 분야 사람들이 모임. 
]

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# 경험

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# 수학올림피아드

수학과만 생각했는데 의대 입학

- 1학기 수시: 올림피아드 전형

의대 적응 못함

- 6년內 면허취득 마지노선

- 인턴 탈락

학원강사

- 본과 2학년말부터 대치 위OO.

- 30살까지 수원 프OOOO, 대치 위OO.

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# 예방의학

전공의

- [서울대 보건대학원](http://health.snu.ac.kr/node/104) 예방의학교실

- **임상의학 아님**. 관악캠퍼스 소속으로 타 과와의 연계가 장점.

석사 및 박사 수료

- 서울대 보건대학원 [유전체역학 연구실](http://snugepi.snu.ac.kr/)

- 유전체 데이터 분석 방법론 연구.

[R](https://www.r-project.org/), [python](https://www.python.org/), 리눅스 이용 시작. 지인 상대로 통계 자문 시작.

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# [삼성전자](http://health.chosun.com/news/dailynews_view.jsp?mn_idx=165897)

박사과정과 응급실 당직 병행 중, 지도교수님 통해 우연히 제의받음.

- 면접 후 2년 3개월 계약직으로 입사.

DMC 연구소로 입사 10개월만에 무선사업부로 이동.

- 연구소에서는 디지털헬스 선행 기술 개발팀, 사업부에서는 **삼성헬스** 앱 개발팀.

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# 삼성전자에서 만난 의사.

- 중앙의대卒, 진단검사의학 전문의, 現 근무

- 연세의대 03학번, 인턴中 무선사업부 입사, 사내벤처 1호.

- 美 소아과 의사, 現 근무

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# 사내벤처 C-lab

사내 우수 아이디어 선발, 1년 과제 진행後 스핀오프 결정.

거북목관리 안경테, 1day 통계지원 서비스로 지원했으나 광탈.

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# [**WELT**](https://www.weltcorp.com/)

<div class="figure" style="text-align: center">
<img src="https://encrypted-tbn0.gstatic.com/images?q=tbn:ANd9GcSMwWnFkSB64-AzQn0dC2s6LHYmut4eRPeQBXmuz6xE3lIAnMy2" alt="https://encrypted-tbn0.gstatic.com/images?q=tbn:ANd9GcSMwWnFkSB64-AzQn0dC2s6LHYmut4eRPeQBXmuz6xE3lIAnMy2" width="60%" />
<p class="caption">https://encrypted-tbn0.gstatic.com/images?q=tbn:ANd9GcSMwWnFkSB64-AzQn0dC2s6LHYmut4eRPeQBXmuz6xE3lIAnMy2</p>
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# 퇴사

- 한국수력원자력 탈락.

- 한국투자파트너스, 스틱인베스트먼트 VC 탈락.

의료 쪽 일을 병행하며 의대 입시컨설팅에 도전하기로 함. 
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# 박사과정

- 이론연구자가 되기로 결심하고 통계이론 논문을 작성.

- 해외 논문 게재 실패. 박사 학위도 어려움.

- 결국 자체 [블로그](https://blog.zarathu.com/posts/2018-11-08-mdlm/)에 게재.
]

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# 법인설립

연구는 안되는데 창업 공모전은 선정되기 시작.

- ['18년 창업선도대학 (예비)창업팀](https://www.k-startup.go.kr/homepage/businessManage/businessManageFunction.do?sid=111&itemSeq=1060): 블록체인 기반 유전체-건강 빅데이터 구축 및 정밀 의학 솔루션.

- [심평원, 보험공단 주최 보건의료빅데이터를 활용한 창업아이디어 공모전](http://www.hira.or.kr/bbsDummy.do?brdBltNo=9598&brdScnBltNo=4&pageIndex=1&pgmid=HIRAA020041000100): 맞춤형 의학연구 애플리케이션

창업하기로 결심, 블록체인은 엄두가 나지 않음.

- 배운게 도둑질, 원래 하던 통계지원을 하기로 결정하고 1인 법인 설립.

- 선배, 동기들과 그들의 지인들이 주 고객.

- 올해, 팀원 1명 만나는 것이 목표.

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# [2019년 정부 창업지원사업 공고](https://www.k-startup.go.kr/common/announcement/announcementDetail.do)

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# 발표

- 인터뷰, 헬스코리아뉴스: [의사, 진료실 밖에도 할 일 많다](http://health.chosun.com/news/dailynews_view.jsp?mn_idx=165897)

- 삼성서울병원 주관 [디지털헬스케어 해커톤 2018](https://www.digitalhealthhack.org/): [맞춤형 의학통계 애플리케이션](https://github.com/anpanmancorp/dhh2018)

- [R User Conference in Korea(RUCK) 2018](http://ruck2018.r-kor.org/): [맞춤형 의학연구 애플리케이션 개발을 위한 개발 환경 구축](https://jinseob2kim.github.io/swarm-setting/RUCK2018_JSKIM)

- [R User Conference Korea(RUCK) 2019](http://ruck2019.r-kor.org/): [ShinyApps 를 R 패키지로 만들어 CRAN 배포하기](https://jinseob2kim.github.io/LectureRpackage/RUCK2019/)

- CRSCube 발표: [R 활용 연구지원 소개](https://blog.zarathu.com/posts/2019-05-13-rmedicalresearch/)

- 제주대학교 경영학과 초청강의: [괴델의 불완전성 정리](https://blog.zarathu.com/posts/2019-05-20-godelincompleteness/)

- 을지의대 세미나: [공공 빅데이터 분석 경험](https://blog.zarathu.com/posts/2019-09-19-nhiswithr/)

- Shiny 기초학습 워크숍: [서울IT직업전문학교 국비교육](https://blog.zarathu.com/posts/2019-10-26-shinyworkshop2019/)

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# Q & A

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# 임상이 아닌데..

수학인으로서의 정체성.

- 비임상분야 도전의 두려움 << 수학이 아닌 분야 도전의 두려움.

- 의대 안갔으면 학원강사로 계속 살았을 듯.

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# 수학도 아닌데...?

정신승리: 수학의 개념 확장

- 추상화해서 유사성을 찾는 모든 행위를 수학이라고 생각

- 통계, 프로그래밍, 비즈니스 등 어떤 것에서든 수학을 찾을 수 있다.

최고의 수학자는 **유사성 사이의 유사성**을 본다.

- 유사성 사이의 유사성을 발견해나가고, 일에 적용해나가는 것이 목표.

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# 의대에 잘 왔다고 느낄 때.

- 어떤 능력이든 본인이 가진 잠재능력을 살릴 수 있는 큰 판. 
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# 통계와 프로그래밍 공부

적성에 잘 맞음.

- 공간지각력이 떨어져 기하에 약점, 계산하고 식을 다루는 대수에 강점.

- 프로그래밍 언어는 추상대수학이 실제로 구현된 것.

관악캠퍼스의 장점을 활용.

- 수학과 학부, 통계학과 대학원의 수업을 수강신청함.

이젠 공부할 정보가 넘침.

- 검색하면 다 나옴, 일단 시작하는 자세.

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# 창업 도전

창업, 스타트**업**, 유니콘...  거창한 표현 No.

- 백종원 골목식당 푸드트럭 사장님께 감정이입.

- 업의 본질: 가내수공업

- 일본 초밥 명인 OK.

마음가짐

- 일과 인생에 스스로 책임을 진다.

- 민심은 천심이다

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